ImageJ的ー一個軟件來分析和處理該圖像文件。該軟件能夠有效地分析圖像並接受詳細的技術數據。 ImageJ的支持大多數的圖像格式的，並具有一組編輯工具。該軟件能夠產生的各種幾何變換，創建密度直方圖，進行三維可視化，進行圖像之間的邏輯和算術運算等的ImageJ能夠同時與多個圖像工作，應用不同的過濾器，並進行的批處理文件。 ImageJ的包含許多plagins大大擴展軟件的功能。